Protein–RNA interactions for Protein: P27548

Cd40lg, CD40 ligand, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd40lgP27548 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cd40lgP27548 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms