Protein–RNA interactions for Protein: P25911

Lyn, Tyrosine-protein kinase Lyn, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LynP25911 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
LynP25911 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
LynP25911 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
LynP25911 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
LynP25911 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
LynP25911 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
LynP25911 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms