Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Hoxd11P23813 Gm42478-201ENSMUST00000199252 1467 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Tpt1-ps2-201ENSMUST00000120548 521 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm29036-201ENSMUST00000189967 877 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm30708-201ENSMUST00000202183 312 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 CT009728.1-201ENSMUST00000225228 1050 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr1180-201ENSMUST00000099824 1063 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm14358-201ENSMUST00000118458 403 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm37306-201ENSMUST00000193447 1233 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm44226-201ENSMUST00000205203 1195 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm12472-201ENSMUST00000153232 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm21542-201ENSMUST00000182307 993 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 6330419E04Rik-201ENSMUST00000203087 1263 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr858-ps1-201ENSMUST00000212591 930 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm30853-201ENSMUST00000218367 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm35615-201ENSMUST00000221255 719 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr1106-201ENSMUST00000099867 939 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm11985-201ENSMUST00000122910 1007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Vmn2r-ps66-201ENSMUST00000173203 1256 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm27241-202ENSMUST00000185013 570 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm37973-201ENSMUST00000195767 1289 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm42504-201ENSMUST00000198312 525 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm16571-202ENSMUST00000203839 585 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm45607-201ENSMUST00000211143 678 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm7762-201ENSMUST00000220595 604 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm42530-201ENSMUST00000202683 550 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 C030038I04Rik-201ENSMUST00000207840 740 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr1483-ps1-201ENSMUST00000208241 334 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Glipr1l3-201ENSMUST00000220085 892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Rida-201ENSMUST00000022946 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Olfr121-201ENSMUST00000074555 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Hoxd11P23813 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
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