Protein–RNA interactions for Protein: P23299

Kcne1, Potassium voltage-gated channel subfamily E member 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcne1P23299 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Kcne1P23299 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Kcne1P23299 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms