Protein–RNA interactions for Protein: P19536

Cox5b, Cytochrome c oxidase subunit 5B, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox5bP19536 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Cox5bP19536 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Cox5bP19536 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms