Protein–RNA interactions for Protein: P19123

Tnnc1, Troponin C, slow skeletal and cardiac muscles, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc1P19123 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Tnnc1P19123 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Tnnc1P19123 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms