Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
P18533 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
P18533 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18533 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
P18533 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
P18533 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P18533 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P18533 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P18533 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.5 ms