Protein–RNA interactions for Protein: P18530

Ig heavy chain V region 7-39, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18530 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
P18530 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
P18530 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
P18530 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
P18530 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
P18530 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
P18530 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
P18530 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
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