Protein–RNA interactions for Protein: P18181

Cd48, CD48 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd48P18181 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cd48P18181 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cd48P18181 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms