Protein–RNA interactions for Protein: P17919

Hoxb1, Homeobox protein Hox-B1, mousemouse

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Length 297 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb1P17919 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxb1P17919 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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