Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
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PcnaP17918 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
PcnaP17918 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
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PcnaP17918 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
PcnaP17918 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms