Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ccl3P10855 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ccl3P10855 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ccl3P10855 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ccl3P10855 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms