Protein–RNA interactions for Protein: P10493

Nid1, Nidogen-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nid1P10493 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nid1P10493 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nid1P10493 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms