Protein–RNA interactions for Protein: P10284

Hoxb4, Homeobox protein Hox-B4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxb4P10284 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm6546-201ENSMUST00000192096 766 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Hoxb4P10284 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm20815-201ENSMUST00000115496 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm21812-202ENSMUST00000188908 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Gm45878-201ENSMUST00000211839 241 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Hoxb4P10284 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms