Protein–RNA interactions for Protein: P09631

Hoxa9, Homeobox protein Hox-A9, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa9P09631 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Hoxa9P09631 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Hoxa9P09631 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms