Protein–RNA interactions for Protein: P07141

Csf1, Macrophage colony-stimulating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf1P07141 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf1P07141 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf1P07141 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Csf1P07141 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms