Protein–RNA interactions for Protein: P06324

T-cell receptor gamma chain V region DFL12, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06324 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
P06324 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
P06324 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P06324 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06324 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
P06324 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P06324 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P06324 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P06324 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P06324 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms