Protein–RNA interactions for Protein: P04945

Ig kappa chain V-VI region NQ2-6.1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04945 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P04945 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P04945 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P04945 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P04945 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P04945 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04945 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P04945 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms