Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
H2-Eb1P04230 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
H2-Eb1P04230 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms