Protein–RNA interactions for Protein: P04224

H-2 class II histocompatibility antigen, E-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P04224 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
P04224 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.06■□□□□ 0
P04224 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
P04224 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.05■□□□□ 0
P04224 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
P04224 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
P04224 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
P04224 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
P04224 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
P04224 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms