Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
P01652 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
P01652 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
P01652 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
P01652 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
P01652 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
P01652 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms