Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apaf1O88879 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apaf1O88879 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms