Protein–RNA interactions for Protein: O88874

Ccnk, Cyclin-K, mousemouse

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Length 554 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcnkO88874 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
CcnkO88874 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CcnkO88874 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnkO88874 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CcnkO88874 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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