Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Arl6O88848 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms