Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Hcn2O88703 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Hcn2O88703 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms