Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Capns1O88456 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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