Protein–RNA interactions for Protein: O70456

Sfn, 14-3-3 protein sigma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfnO70456 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
SfnO70456 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
SfnO70456 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
SfnO70456 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
SfnO70456 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
SfnO70456 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
SfnO70456 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
SfnO70456 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms