Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

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Length 412 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdkO55028 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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BckdkO55028 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
BckdkO55028 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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