Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SlkO54988 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SlkO54988 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SlkO54988 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SlkO54988 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.89■□□□□ 0.78
SlkO54988 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SlkO54988 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SlkO54988 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
SlkO54988 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
SlkO54988 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.7 ms