Protein–RNA interactions for Protein: O54788

Dffb, DNA fragmentation factor subunit beta, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffbO54788 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
DffbO54788 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
DffbO54788 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
DffbO54788 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
DffbO54788 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
DffbO54788 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
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