Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Opn1mwO35599 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Opn1mwO35599 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.3 ms