Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.8
Polr1aO35134 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Polr1aO35134 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms