Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Casq1O09165 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Casq1O09165 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
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