Protein–RNA interactions for Protein: O08842

Gfra2, GDNF family receptor alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra2O08842 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gfra2O08842 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gfra2O08842 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms