Protein–RNA interactions for Protein: O08738

Casp6, Caspase-6, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp6O08738 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Casp6O08738 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Casp6O08738 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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