Protein–RNA interactions for Protein: K7N6U2

Gm3542, Predicted gene 3542, mousemouse

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Length 270 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3542K7N6U2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Gm3542K7N6U2 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Gm3542K7N6U2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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