Protein–RNA interactions for Protein: J3QPU5

Ccer2, Coiled-coil glutamate-rich protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer2J3QPU5 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ccer2J3QPU5 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ccer2J3QPU5 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms