Protein–RNA interactions for Protein: J3QPI0

Gm8298, Predicted gene 8298, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8298J3QPI0 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm8298J3QPI0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Gm8298J3QPI0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms