Protein–RNA interactions for Protein: J3QNM1

Cldn34c2, Claudin 34C2, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c2J3QNM1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34c2J3QNM1 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c2J3QNM1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
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