Protein–RNA interactions for Protein: J3QML3

Btbd35f30, BTB domain-containing 35, family member 29, mousemouse

Predictions only

Length 498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Btbd35f30J3QML3 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Btbd35f30J3QML3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Btbd35f30J3QML3 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms