Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

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Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Cldn34c3J3QJW5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Cldn34c3J3QJW5 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
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