Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Gm21060J3KMU4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
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