Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

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Length 170 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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Gm21818J3KMS6 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm21818J3KMS6 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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