Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

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Length 855 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Taf4bG5E8Z2 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Taf4bG5E8Z2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
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