Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Trim15G3UY57 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms