Protein–RNA interactions for Protein: F6Z9R1

Gm20538, Predicted gene 20538 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 75 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20538F6Z9R1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mib2-201ENSMUST00000103176 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Vash1-201ENSMUST00000021681 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rangap1-201ENSMUST00000052374 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Kcnj12-203ENSMUST00000108717 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pcdha1-202ENSMUST00000193839 4925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Epb41-203ENSMUST00000084253 5141 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Edrf1-201ENSMUST00000051169 5424 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Plcb2-202ENSMUST00000102524 5145 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC8.11□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Setd1a-201ENSMUST00000047075 6487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Micu1-204ENSMUST00000165563 2442 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tepsin-201ENSMUST00000026442 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 4631405K08Rik-201ENSMUST00000180420 2112 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Mroh1-204ENSMUST00000159218 5085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.1□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Ube2k-210ENSMUST00000202679 4682 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rab11fip3-203ENSMUST00000122103 5015 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Npc2-201ENSMUST00000021668 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Brdt-201ENSMUST00000031215 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Trim46-201ENSMUST00000041022 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Sgo2a-201ENSMUST00000027202 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Dab2ip-201ENSMUST00000065001 6392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Kcnd1-201ENSMUST00000009875 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Tsku-202ENSMUST00000164726 2620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Gm20538F6Z9R1 Kif1c-202ENSMUST00000094499 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms