Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7Q1

Gm5407, Predicted gene 5407, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5407E9Q7Q1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Gm5407E9Q7Q1 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms