Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6Y8

Usp31, Ubiquitin-specific peptidase 31, mousemouse

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Length 1,344 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp31E9Q6Y8 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Usp31E9Q6Y8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Usp31E9Q6Y8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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Usp31E9Q6Y8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
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Usp31E9Q6Y8 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Usp31E9Q6Y8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Usp31E9Q6Y8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
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