Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y3

4930546C10Rik, RIKEN cDNA 4930546C10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930546C10RikE9Q4Y3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.5
4930546C10RikE9Q4Y3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.9□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.89□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.88□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
4930546C10RikE9Q4Y3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms