Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4U5

Vmn2r56, Vomeronasal 2, receptor 56, mousemouse

Predictions only

Length 779 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn2r56E9Q4U5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn2r56E9Q4U5 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Vmn2r56E9Q4U5 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms